草藥醫學中有一個很特別的概念，那就是「藥草親和力」（herbal affinity）。在醫學院時，從沒有人教過我這個概念。在對抗療法中，我們是從藥物的角度來思考，衡量它們如何影響不適感或疾病，如果有感染，那就用抗感染的藥劑使其平靜下來，有些則是設計來刺激生理過程的藥物，例如，藥用大麻中的屈大麻酚可用於刺激食欲，而苯丙胺（安非他命）則用於刺激大腦。

在草藥醫學中，藥草具有廣泛的應用和作用，但對一器官系統會具有特定的親和力。比方說：

抗焦慮藥草卡瓦醉椒最初之所以被引進美國，就是因為它對泌尿系統具有親和力，可做為膀胱抗痙攣藥物；它能夠使人在放鬆身體的同時仍保持頭腦清醒。此外，山楂對心血管系統有親和力，而覆盆子葉則對子宮有親和力。

在草藥醫學中，使用某一藥草不僅是因為需要其作用，也是因為它對相關器官的親和力，例如：

洋甘菊具有抗痙攣作用，同時還對胃腸系統有親和力。所以，若是有腸絞痛，會選擇洋甘菊，因為它對胃腸系統的親和力，同時又有抗痙攣作用；若是小腿肌肉痙攣，則會選擇抗痙攣的歐洲莢蒾，因為它對肌肉痙攣具有親和力。

藥草通常具有多種作用，並且對身體的多個部位具有親和力。舉例來說：

黑升麻能夠在身體的關節和肌肉處發揮抗發炎和止痛的作用，過去有人會拿它來治療風濕性關節疼痛──例如骨關節炎。然而，它也有助於治療出現在人們身上的深沉、陰暗情緒，即所謂的憂鬱症。這些情緒可能是偶發的，有時是伴隨月經週期，並且可能會讓人陷入非常黑暗的情緒中。

有些藥草的作用是根據植物的外觀或自然功能來推測。

黑升麻這種植物的頂部長有輕盈、美麗的花序，在地底下的根則是深沉、陰暗並纏繞成一團。黑升麻的內部（根部）是一團糾結的混亂，但外表卻是美麗的，因此，我們希望這種植物能夠在內心糾結但表面上仍然完好無事的人身上發揮作用。又如柳葉馬利筋根，柳葉馬利筋是一種外型類似於肺葉構造的植物。柳葉馬利筋根對肺和胸膜（這是一種覆蓋在胸腔肋骨表面的薄膜，也覆蓋在整個肺葉上）具有很強的親和力。

在藥物醫學中，我們會試圖一一分離出藥草中的化學物質，找出具有某種藥效的物質，而在草藥醫學中，同樣的藥草則可用於治療多種症狀，例如前述的黑升麻，其實還可以用於治療哮喘或支氣管炎。在以藥物治療為導向的醫師眼中，治療哮喘和關節痛竟然會使用相同的藥物似乎很奇怪，但在草藥醫學中，這是司空見慣的。